风水罗盘用什么软件好准_最实用的风水罗盘下载软件

　　本文作者是Raindy，感谢Raindy先生的无私分享！

　　一提到多重序列比对，很多人禁不住就想到ClustalW（Clustalx为ClustalW的GUI版），其实有一款多重序列比对软件——MAFFT，无论从比对速度（Muscle>MAFFT>ClustalW>T-Coffee），还是比对准确性（MAFFT>Muscle>T-Coffee>ClustalW）来说，其相比于ClustalW（或ClustalX）有过之而无不及，所以我们强烈推荐使用MAFFT这款多重比对软件。

MAFFT主界面

　　简明操作流程

　　1

　　载入序列文件

　　将FASTA格式的待比对序列文件（如：TMV.fas） 复制MAFFT的根目录下（当然也可以放任意位置，只有找得到），双击“mafft.bat”启动MAFFT，此时提示输入文件（Input file?），在@后面输入示例的TMV.fas，也可以直接将文件拖入窗口（注意有个+，说明当前是拖放状态），如下图所示：

　　加载后回车，当显示“OK”时说明载入文件成功。

　　2

　　设置输出信息

　　输出文件名称自定义，扩展名任意，这里保留原扩展名，输出文件名为TMV-out.fas，确定后回车。

　　输出文件格式，建议用3或4，这里在@后输入4后回车，此时出现 MAFFT三种主要比对策略的5个选项，如下图：

　　当你无法确定时候，建议用第1种的--auto模式，让MAFFT根据序列的特点自动选择相应的比对策略，输入1后回车。

　　当不需要附带参数时，直接回车。

　　3

　　开始多重比对

　　一切设置完毕，输入“Y”回车，程序自动开始比对。

　　当出现输出文件名，说明比对完成。

　　4

　　后续着色美化

　　序列比对完成，还有重要的工作就是美化。比如这样：

　　或者这样：

　　黑白变彩色，《nature》文章的即视感有木有！作为一个热心的小编，当然也公开分享MAFFT下载地址吖：

　　http://mafft.cbrc.jp/alignment/software/